Online
Di balik kegelapan, seorang samurai bertopeng membunuh lima orang di seluruh kota metropolitan Jepang: tiga di Tokyo, satu di Osaka, dan yang terakhir di Kyoto. Dalam penyelidikan mereka, polisi mengetahui bahwa masing-masing pria itu adalah anggota Genjibotaru—geng pencuri yang berfokus pada pencurian patung dan artefak Buddha dan yang menggunakan nama-nama pelayan Minomoto no Yoshitune. Tanpa motif yang jelas atau petunjuk tentang identitas anggota lainnya, kasus tersebut tidak kunjung terungkap hingga sebuah kuil Kyoto memanggil Kogorou Mouri yang terkenal. Setelah menerima surat anonim yang berisi teka-teki aneh, para biksu kuil meminta bantuannya untuk memecahkan teka-teki tersebut guna mendapatkan kembali patung mereka yang telah lama hilang. Sementara itu, Conan Edogawa dan detektif SMA Heiji Hattori bekerja sama untuk memecahkan teka-teki misterius itu dan menemukan pembunuhnya, saat Hattori mencari cinta masa kecilnya. Dengan pengetahuan Hattori tentang Kyoto, keduanya menjelajahi jalanan dan perlahan menemukan kebenaran, tetapi tidak sebelum si pembunuh beraksi lagi—membunuh anggota Genjibotaru lainnya dan, setelah berulang kali mencoba membunuh Hattori, akhirnya menculik kekasih masa kecil Hattori. Hanya dengan bekerja sama untuk mengungkap petunjuk yang terkubur, Conan dan Hattori dapat berharap untuk mengakhiri pertumpahan darah samurai jahat itu dan menyelamatkan cinta Hattori.